Excelente herramienta usada por varias corporaciones y lo Mejor gratis.

Herramienta clásica enfocada al desarrollo ágil de productos.

Permite realizar tracking es decir Seguimiento entre horas, la competencia de basecamp.

ofrece servicios a usuarios para desarrollo ágil, una gran desatacada que no le guarda menor respeto a las grandes herramientas

Realizada en España muy nueva y se encuentra en reinvención constante su tablero para gestión de equipos pequeños y lo mejor es gratis

Trello 

a mi perspectiva la mejor del mercado gratuito por su facilidad de uso de tableros con seguimiento y uso de pluggins e integra otras interesantes herramientas, aunque satanizada por otros comentarios que no es la mejor para las métricas.

scrumwise

Permite crear equipos y asignar funciones, realizar un seguimiento de la velocidad del equipo, y trabajar en distintas zonas horarias. Crear retrasos y organizarlas con listas, etiquetas y filtros. Dividir el trabajo en partes manejables utilizando subtareas y listas de comprobación.