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A implementação da espectrometria de massa (MS) para as análises de peptídeos (MS) e de aminoácidos (MS em tandem ou MS/MS) tornou possível a identificação de centenas de proteínas em experimentos únicos. Uma grande variedade de estratégias está disponível atualmente para o fracionamento e a purificação de amostras, a identificação de proteínas, a quantificação, a análise de modificações pós-traducionais (MPT’s) e os estudos de interação. Dessa forma, a proteômica abre novas perspectivas na biologia de plantas com ênfase nos estudos de variabilidade genética, estresses fisiológicos e desenvolvimento de plantas.
O que é a Proteômica,e o que o Brasil tem produzido no campo cientifico?
A Proteômica enquanto Ciência consiste no estudo sistemático das proteínas presentes em um sistema biológico. Depois do sequenciamento dos genomas, seguiu-se a necessidade de uma compreensão mais refinada do produto codificado pelos genes. A partir de então, inferiu-se que as proteínas representam a chave para o entendimento de processos complexos e dinâmicos relacionados aos genes. Por isso, processos pervasivos que transcendem a relação direta sequência-proteína (e.g. modificações co-traducionais e pós-traducionais - fosforilação, metilação, acetilação, clivagem proteolítica, etc...), somente ganham visibilidade quando a observação se dá em nível de expressão de proteínas e de peptídeos. A aplicação de técnicas analíticas como a eletroforese bidimensional , a espectrometria de massas e ainda da Bioinformática possibilitou a resolução simultânea de grande quantidade de proteínas, com sensibilidade e reprodutibilidade.
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E o que outros paises estão fazendo?
O conceito de genômica estrutural surgiu em meados da década de 1990 nos EUA e no Japão como uma resposta para o sucesso da alta taxa de transferência (HTP)em métodos utilizados para o seqüenciamento de genomas inteiros. Seguiu-se que métodos HTP semelhantes Poderiam Ser aplicados para obter estruturas 3-D de todas as proteínas no organismo, o que iria preencher as lacunas observadas no espaço-dobra ". Esta visão levou ao investimento de vultosas somas de dinheiro de empresas em larga escala estruturais com projetos de genômica no Japão e EUA. Recursos para projetos de teses foram canalizados e estavam em um pequeno número de centros de pesquisas; o desenvolvimento de novas tecnologias automatizadas para permitir uma abordagem do HTP para determinação das estruturas e um foco em espaço-dobras como outros critérios e objectivos principais aceleraram os processos de mapeamento genetico.
Seguido da Europa com a criação da Fábrica de Estrutura de Proteínas em Berlim, Alemanha, Oxford Centro de produção de proteína (OPPF) em Oxford, Reino Unido e os Genopoles na França. No entanto, em outubro de 2002, o projeto à escala européia pela primeira vez com a visão de alguns cientistas que levaram à formação de um consórcio de laboratórios de biologia estrutural. O projeto, financiado pelo 5 º PQ da UE programa chamado Proteomics Estruturais na Europa . PILAR, um projeto de 'segunda geração' proteômica estrutural beneficiou-se da experiência e desenvolvimento de tecnologia dos projetos anteriores, enquanto uma abordagem mais focada para seleçao alvo. Este foi o iniciador de uma série de projetos estruturais em proteômica, financiado pela União Europeia que reforçou e ampliou o consórcio cada vez mais desafiador de tais metas que poderiam ser abordadas a médio prazo.
Fontes:
Susan Daenke A Universidade de Oxford, Strubi
NCRS/FOUNDATION
UNIFESP
UNICAMP
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